第三章 脱靶
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第1o8章 脱靶
“cRIspR-cas9技术展到现在，其实已经有很多改良，可以有效降生脱靶效应的概率。”戴定波笑着说道，“但我们还是用了最经典的技术，目的就是想让你看看，基因编辑技术的缺陷在哪里。”
阮志宁若有所思的点头，理解了戴定波的话中之意“也就是说，你们更倾向于研一个新的基因编译技术，而不是改进现有的基因编译技术。”
戴定波没有确认也没有否认“我们必须要弄清楚其他所有技术的缺陷，以及造成这种缺陷的机制，才有可能开出更新的技术。”
机制……
阮志宁注意到了戴定波的用词——这说明，在这个博士眼中，cRIspR-cas9基因编译技术的缺陷可以被改良，但是永远不可能彻底摈除。
虽说不成熟的技术也经常被用在人体上，但绝不可能大规模普及。
“那么，你们现在有什么进展吗？”阮志宁问道，“伱们是不是已经找到了一些新的思路或者方法？”
硅锡钠生命被现也有一段时间了，基因奥秘实验室不可能没有拿到样本，说不定他们就能够在这种新生命身上现一些新思路？
戴定波知道阮志宁指的是硅锡钠生命，他摇摇头道“其实，我们现在还处于探索阶段，我们只是在做一些基础的实验，距离彻底揭开硅锡钠生命的运作机制还需要一定的时间。”
“那你们有没有考虑过用人工智能来辅助你们的研究呢？”阮志宁提出了一个建议，“我听说有些人工智能系统可以模拟基因编译的过程，甚至可以预测脱靶效应的生概率和后果。”
如今智能人展如此迅猛，在生物学领域也一定挥了作用。
戴定波笑了“阮教授，您的合成思维矩阵确实十分厉害……但智能人只是拥有强大的计算能力和模拟人类的思维方式。想要研出新东西，同样需要创造力和直觉。只有强大的计算力，充其量是改良技术，做不到开出新技术。”
这话阮志宁倒是颇为赞同——如今祖国不知已经生产出多少智能人，但能够投身于科研创新领域的还是少之又少，比例甚至比人类还要低！
小风只是一个特例，不代表所有智能人都有小风的创新水平。
阮志宁若有所思的点头“你们尝试过对硅锡钠生命进行基因编译了？”
“我们当然尝试过，效果不能说没有。我们的基因编译技术能对硅锡钠生命产生影响，但这种影响非常不可控，甚至有时候会引起反应，导致硅锡钠生命的基因生变异或者破坏。”戴定波回答道。
“有反应就足够了！这说明碳基生物和硅锡钠生命在某种程度上有共通点！”阮志宁眼中闪过一丝光芒，“这说明，我们可以从硅锡钠生命上找到灵感！”
要知道碳基生命和硅锡钠生命可是完全不同的两种生命形式！
不怕技术不够，就怕没有思路。
“比起这个，阮志宁，你要不还是先看看，导致这次实验脱靶效应的原因是什么？”戴定波把话题扯了回来，用手指点了点不远处的dna分析仪。
要操作dna分析仪？
还是有些照顾我啊，阮志宁低笑一声，随即开始将小白鼠待测的dna样品，进行pcR扩增、纯化、定量和稀释处理。
让其他助手选择好电泳缓冲液、聚合物、染料和分子量标准品后，阮志宁将所有的东西装载到了相应的位置，将dna样品按照规定的顺序和格式装载到样品板上。
“不像是新手嘛。”欧阳妍笑了一声，“真的是第一次接触这种实验？”
阮志宁嘿的笑了一声“我还在没实验的情况下把解决可控核聚变的材料给解决了呢。”
“您是真没架子啊……”
说着，他将样品板放入仪器的板进样器中，设置好运行参数和数据采集软件。
下一秒，dna分析仪启动，电泳运行开始运行。
“接下来只需要等待电泳运行结束，就可以查看和分析数据了。”阮志宁操作完最后一步，转头看向戴定波，“怎么样，我这一套操作流程没有任何不规范的地方吧？”
戴定波肯定道“不愧是阮志宁。”
半个小时之后，电泳运行结束，各个参数都被显示在了仪器之上。
很快，阮志宁就在数据中找到自己失败的原因。
“我设计的sgRna长度只有25个碱基，它以完全配对的形式结合到与靶基因相似的其他基因上，产生了脱靶效应。”阮志宁叹了一口气，“这种情况有点难以避免啊。”
戴定波点了点头，说道“这是neteta的长度和特异性是一个难以平衡的问题。如果sgRna太短，就容易生脱靶效应；如果sgRna太长，就容易生结合效率低或者结合不稳定的问题。而且，不同的基因组中，相似的基因序列可能有很多，很难找到一个完全没有脱靶风险的sgRna。”
“没有完美的解决方案。”欧阳妍补充道，“我们可以设计特异性和稳定性都较高的sgRna，可以通过突变cas9核酸酶提高切割精度，我们可以利用同源重组修复来修复dna双链断裂，但这些都不能完全解决问题。”
很多人都尝试过用一些化学修饰或者核酸工程来改变sgRna的结构和性质，但是这些方法都有局限性和副作用。
戴定波甚至尝试过用一些其他的核酸酶或者核酸识别因子来替代cas9，但是这些方法都需要重新设计和优化sgRna。新的设计可能会解决旧的问题，可同样也会带来各种新的问题。
就像程序员修bug，经常会遇到老bug修好，但又出现了新bug的情况。
这就是所谓的“屎山”代码，和基因有异曲同工之妙。
基因编译技术已经展到了一个很高的水平，可还是不能随心所欲地改变任何生物的基因。
“所以？”阮志宁觉得这个实验室的人搞这么多东西，就是为了给自己来一个“大的”。
此时，实验室的负责人邓立彬教授也走了过来，他一改昨日嘻嘻哈哈的表情，十分严肃的问道“阮志宁院士，我想问一问你……你加入我们实验室，最终的目标是什么？”
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